零排放厕所的工作原理：贵州智勇联创环保科技有限公司制作的智能生态厕所利用成都香阁里科技有限公司自主研发的超强劲的复合微生物菌群，将锯末、谷壳、中药杀菌剂、抗氧化粉、元宝粉等有机物经过加工处理制成垫料置入微生物降解床池。人的粪便排泄在此垫料上，设备启动搅拌将其混匀，由有益动能微生物快速大量繁殖过程中形成的强大生物反映，完成对有机物料的脱臭、腐熟、杀虫、灭菌等处理，达到无臭、零排放、零污染、净化环境，生态环保的效果。
零排放厕所的生物降解过程：当粪尿与微生物及载体充分混合后，首先，微生物水解菌种释放具有降解有机物功能的高蛋白酶，将粪尿中的有机物降解为糖、脂肪酸和氨基酸等小分子有机物，微生物产酸菌种再将其降解为有机酸，经甲烷菌的进一步作用及代谢、完全氧化分解为水、气体等简单的无机物，而菌群自身也同时以几何级数繁殖。降解过程中产生的水分及其它气体直接蒸发排出，分解后及少量的余渣富含有机质、N/P/K和微量元素，可回收为高效有机肥料，同时包含大量好氧微生物的高效生物活性肥料，可将粪尿中的臭气吸收转化，实现粪尿的分解，脱臭、净化一体化处理，而粪尿中的大肠杆菌、寄生虫卵等有害病菌及杂菌也被微生物群落所吞噬，从而实现安全卫生无害化。