年8月4日，锐翌基因与重庆医院在《Microbiome》合作发表研究成果《AMetagenomicStudyoftheGutMicrobiomeinBehcet’sDisease》。作为合作单位，锐翌基因承担了测序分析以及数据深度挖掘工作。
文献信息
英文题目：AMetagenomicStudyoftheGutMicrobiomeinBehcet’sDisease
中文题目：白塞病患者肠道微生物的宏基因组研究
发表期刊：Microbiome
发表时间：影响因子：9.
发表单位：重庆医院
测序产品：宏基因组测序，16S扩增子测序
测序平台：IlluminaHiSeq；IlluminaMiSeq
检索：doi.org/10./s---6
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研究背景
白塞病（Behcet’sdisease，BD）是一种多器官受累的自身炎症性疾病，以反复发作的口腔及生殖器溃疡、皮肤损害及葡萄膜炎为典型的临床表现。BD多发生于青壮年，炎症反复、治疗棘手，所致的盲目多为不可逆盲，严重影响患者的生存质量。
以往研究发现，遗传因素及自身炎症反应参与BD的发病。BD患者体内Th1及Th17细胞过度激活，调节性T细胞（Treg细胞）数量及功能异常。
近期有研究表明肠道微生物在调节Th1，Th17和Treg细胞中起到至关重要的作用，且肠道微生物紊乱与许多自身免疫性疾病如风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等有关，与BD也有关。
然而，之前的研究基于16S扩增子测序分析，有一定的局限性，例如由于扩增子偏倚造成的微生物组成偏差以及16S测序技术鉴定不到菌种和菌株水平的局限。
为了更全面的研究BD患者微生物的组成，文章中采用宏基因组的测序技术研究BD患者和健康人肠道菌群组成的差异，结果表明BD患者和健康人的肠道微生物组成有明显不同。利用粪菌移植的技术将患者的粪便菌群移植到葡萄膜炎动物模型中，使得动物模型的眼部症状加重。基于以上研究，文章建立了一个解释肠道菌群组成和BD发病机制的模型。
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研究内容及技术路线
研究对象
32个BD患者，除了局部使用皮质类固醇滴眼液和睫状肌麻痹剂，没有接受全身药物治疗至少一个月；74个在年龄、性别和BMI较为匹配的健康人。
研究对象排除标准
患有心血管疾病、糖尿病、其他炎症性疾病以及传染病的对象除外，患者一个月内没有服用抗生素或者益生菌。
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研究结果
3.1
肠道微生物组成在BD患者中的变化
收集24个BD患者和52个健康人的粪便样本，进行宏基因组测序，结果发现拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门在患者和健康组中都是主要菌群。有96个属和23个种的丰度在BD组和健康组中有差异。
多达96个属在BD患者中富集，包括38个As白癜风爱心传递分享会北京治疗白癜风究竟花多少钱